mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTATACAATCTACTACCTCA AGGCAATAGATTGTATAGTT ACTCCTCAGGGAAGGCAATAGATTGTATAGTTATCTCCTAAACAGGGTAAAATCACTACCCCACAACTATACAATCTACTACCTCACTCTGATAGAG 5 0 3' arm Rattus_norvegicus mirbase let-7 8e-36 mmu-let-7f-1 2e-45 -30.76 .(((.((((((.(((...((((((((((((((............(((((.......)))))...))))))))))))))...)))..))))))..))) (-30.76)