mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCGGTTATCTAGCTTTAT ACAGCTAGATAACCAAAG GCGCAGTGTATGGGGTTATTTTTACTTTCGGTTATCTAGCTTTATGAAGACTCCACACCACTCATACAGCTAGATAACCAAAGATAACAACCAACCCCGCCTCCTGGC 1 1 5' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-9 7e-24 rno-mir-3597-1 1e-56 -38.54 ((.(((.(..(((((((.((.(((((((.((((((((((((.(((((..............))))).)))))))))))))))).))).))..)))))))...)))))) (-38.54)