mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACAGCTAGATAACCAA CGGTTATCTAGCTTTATGA GCACGCAGAAGTTGTTAGAGTCATTTCTACTTTCGGTTATCTAGCTTTATGACGGCTCTGTGGCACTCATACAGCTAGATAACCAAAGAGAGAAACGGGCCTCCCATTCGCCGGC 1 1 3' arm Rattus_norvegicus mirbase mir-9 5e-28 rno-mir-3597-3 7e-61 -40.7 ((.((..(((..((..((.(((.(((((.((((.((((((((((((.(((((..(((....)))..))))).)))))))))))))))))))))....)))))..)))))..)))) (-40.70)