mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTT CAACAAGTCCCAGTCTGCCGCA GTGGAGCAGCCAGCCCCATCTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTGTCTCCTGCGCTCAACAACAAGTCCCAGTCTGCCGCATGGTGCTGGCCACCGCA 2 2 5' arm Bos_taurus mirbase mir-7 5e-43 mml-mir-7-2 2e-23 -44.2 ((((....((((((.((((.(((.(((((.(.(((((.(((((((...........))))))))))))).))))).))).)))).))))))..)))). (-44.20)