mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATG TAAAGCTAGATAACCGAAAGTA GGAAGCGAGTTGTTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTATTGGTCTTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAAAAACTCCTTCA 3 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-9 2e-17 age-mir-9 3e-44 -40.1 .((((.(((((.(((..(((((((((((((((.((((((..(....)..)))))).)))))))))))))))..))).))))))))). (-40.10)