mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACGTAAATATTGGTG CCAGTATTAACTGTGCTGCTGAA GTCAGCAGTGCCTTAGCAGCACGTAAATATTGGTGTTAAGATTCTAAAATTATCTCCAGTATTAACTGTGCTGCTGAAGTAAGGTTGGC 2 1 5' arm Bos_taurus mirbase mir-16 4e-37 age-mir-16 7e-42 -37.4 ((((((..(((.((((((((((((.((((((((.(.(((..........))).).)))))))).)).)))))))))).)))..)))))) (-37.40)