mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACGTAAATATTGGC CAATATTATTGTGCTGCTTTA CATACTTGTTCCGCTGTAGCAGCACGTAAATATTGGCGTAGTAAAATAAATATTAAACACCAATATTATTGTGCTGCTTTAGCGTGACAGGGA 4 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-16 3e-32 rno-mir-16 1e-40 -40.2 ....(((((..(((((.(((((((((..((((((((.((((((.......))))..)).))))))))..))))))))).)))))..))))).. (-40.20)