mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATTGCACTTGTCTCGGTCTGA AGGCGGAGACTTGGGCAATTGCT GGCCAGTGTTGAGAGGCGGAGACTTGGGCAATTGCTGGACGCTGCCCCGGGCATTGCACTTGTCTCGGTCTGACAGTGCCGGCC 6 1 3' arm Bos_taurus mirbase mir-25 2e-36 eca-mir-25 4e-40 -39 ((((.(..(((..((((.(((((..(.(((((.(((((........)).)))))))).)..))))).))))..)))..).)))) (-39.00)