mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCCG GGGCTTAGCTGCTTGTGAGCA TGGCCTGGGGAGCAGGGCTTAGCTGCTTGTGAGCAGGTCCACATCAAATCGTGTTCACAGTGGCTAAGTTCCGCCCCC 3 1 3' arm Bos_taurus mirbase mir-27 2e-26 bta-mir-27a 5e-39 -39.2 ......((((.((.(((((((((..((.(((((((.(............).)))))))))..))))))))).)))))) (-39.20)