mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCTGC AGAGCTTAGCTGATTGGTGAACA ACCTCTCTGACGAGGTGCAGAGCTTAGCTGATTGGTGAACAGTGACTGGTTTCCGCTTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGCACCTGAAGAGAAGGTG 2 2 3' arm Bos_taurus mirbase mir-27 1e-28 mml-mir-27b 5e-43 -50.4 ((((((((....((((((((((((((((((....((((((((....(((...)))..))))))))..))))))))))))))))))..)))).)))). (-50.40)