mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGAGCTCACAGTCTATTGAG TTCCCACTAGATTGAGAGCTCCTGGA GGTCCTTGCCCTCAAGGAGCTCACAGTCTATTGAGTTGCCTTTCTGACTTTCCCACTAGATTGAGAGCTCCTGGAGGGCAGGCACT 3 4 5' arm Bos_taurus mirbase mir-28 3e-35 eca-mir-28 2e-41 -45.2 (((.(((((((((.((((((((.(((((((.((((((........))))....)).))))))).)))))))).))))))))).))) (-45.20)