mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGTGTT GCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGA CTTCTGGAAGCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGATTTTTCCATCTTTGTATCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTTTAGGAG 1 3 3' arm Bos_taurus mirbase mir-29 6e-27 eca-mir-29b-2 9e-41 -31.24 (((((((((((((((((((.((((((.((.((((..............)))))))))))).)))))))))).))))))))) (-31.24)