mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCATCATTTGAAATCAGTGTTT AGCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGA CTTCTGGAAGCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGATTTTTCCATCTTTGTATCTAGCATCATTTGAAATCAGTGTTTTAGGAG 1 3 3' arm Bos_taurus mirbase mir-29 1e-24 eca-mir-29b-2 2e-38 -28.64 (((((((((((((((((((.((((((.((.((((..............)))))))))))).)))))))))).))))))))) (-28.64)