mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGCTGTTGCATTGC AGTGCCTCGGCAGTGCAGCCC GCGGGCGGCCCCGCGGTGCATTGCTGTTGCATTGCATGTGTGAGGCAGGTGCAGTGCCTCGGCAGTGCAGCCCGGAGCCGGCCCCTGGCACCGC 2 1 5' arm Bos_taurus mirbase mir-33 4e-22 mml-mir-33b 1e-40 -58.2 ((((.((((.(((.((((((((((((..(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))).))))).))))(((...))).)))) (-58.20)