mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGT AATCAGCAAGTATACTGCCCTA GGCCAGCTGTGAGTGTTTCTTTGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTTGTGAGTAATAATGCAGGAAGCAATCAGCAAGTATACTGCCCTAGAAGTGCTGCACGTTGTGGG 1 2 5' arm Bos_taurus mirbase mir-34 2e-33 lla-mir-34a 6e-49 -46.4 ..(((((.(((((..(((((..(((((((((((.((((((((((....(((....)))....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))))).).. (-46.40)