mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCAACGGGTATTTATTGAGCA CTCAATAAATGTTTGTTGAATT AACACAGCGGGCGCTCAATAAATGTTTGTTGAATTGAGATGCGCTAAATTCAACGGGTATTTATTGAGCACCCACTCTGTG 3 0 3' arm Bos_taurus mirbase 100 ssc-mir-95 5e-36 -39.6 ..(((((.(((.((((((((((((..(((((((((.((.....)).)))))))))..)))))))))))).)))...))))) (-39.60)