mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGCACTAGCACATTTTTGCT CAATCATGTGCAGTGCCAATAT CCACTACCGTCTGCTTGGCCGACTTTGGCACTAGCACATTTTTGCTTGTGTCTCTCCGCTCTGAGCAATCATGTGCAGTGCCAATATGGGAAAAGCAGGATGC 3 1 5' arm Bos_taurus mirbase mir-96 3e-35 rno-mir-96 2e-42 -45.1 .......(((((((((..((.(..((((((((.((((((..(((((((((......)))...))))))..))))))))))))))..).))..))))).)))). (-45.10)