mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCCGTAGATCCGAACTTGTG CAAGCTTGTGTCTATAGGTATG CCTGTTGCCACAAACCCGTAGATCCGAACTTGTGGTGGTAGTGCACACAAGCTTGTGTCTATAGGTATGTGTCTGT 6 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-10 8e-26 ssc-mir-100 5e-33 -26.2 ........((((.(((..((((..(((.((((((((......)).)))))).)))..))))..))).))))..... (-26.20)