mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTACTGTGATAACTGAA CAGTTATCACAGTGCTGATGCT AGGCTGCCCTGGCTCAGTTATCACAGTGCTGATGCTGTCCATTCTAAAGGTACAGTACTGTGATAACTGAAGGATGGCAGCCA 1 1 3' arm Bos_taurus mirbase mir-101 9e-29 mmu-mir-101a 6e-42 -47.3 .(((((((.....((((((((((((((((((.((((............)))))))))))))))))))))).....))))))). (-47.30)