mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAAG CCGTGTTCACAGCGGACCTTGAT ATCAAGATCAGACTCTGCCCTCCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGCGGAGCCTACAGGCGGCTGCACTTGAA 5 0 3' arm Bos_taurus mirbase mir-124 9e-39 ssc-mir-124a-1 2e-45 -42 .(((((..(((..(((((.((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..)).)))))(((....)))..)))..))))). (-42.00)