mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAAG GCGTGTTCACAGCGGACCTTGAT TGAGGGCCCCTCTGCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCTATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGAGGCGCCTCC 3 2 3' arm Bos_taurus mirbase mir-124 2e-27 hsa-mir-124-3 3e-44 -40.3 .(((((((.(((((.((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).))))))))).)))).))).)))). (-40.30)