mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA ACGGGTTAGGCTCTTGGGAGC CGCGCGCCTCTCAATCCCTGAGACCCTAACTTGTGATGTTTACCGTTTAAATCCACGGGTTAGGCTCTTGGGAGCTGCGAGTCGCGCC 2 1 5' arm Bos_taurus mirbase lin-4 4e-31 eca-mir-125b 2e-39 -42.3 .(((((.(((.((.((((.((((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).))))))))..)).))).))))). (-42.30)