mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTACCGTGAGTAATAATGCG ACATTATTACTTTTGGTACGCG TGACGGGACATTATTACTTTTGGTACGCGCTGTGACACTTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCGCTGTCA 2 1 3' arm Bos_taurus mirbase mir-126 2e-26 ssc-mir-126 7e-35 -31.5 .((((((.(((((((((((.(((((((.(...(((....)))..).))))))).)))))))))))).))))). (-31.50)