mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATAAAGTAGAAAGCACTAC AGTGTTTCCTACTTTATGGA GACAGTGCAGTCACCCATAAAGTAGAAAGCACTACTAACAGCACTGGAGGGTGTAGTGTTTCCTACTTTATGGATGAGTGTACTGTG 1 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-142 2e-42 mml-mir-142 3e-44 -44.7 .((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((...(..(....)..)..))))))))).))))))))))).))).)))))))). (-44.70)