mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGCAATGATATTGTCAAAGCAT GCTCTGACGAGGTTGCACTACTGTGCT TCCTGCTGGCCGCAGGTGCTCTGACGAGGTTGCACTACTGTGCTTTGAGGAGCAGTGCAATGATATTGTCAAAGCATCCGGGACCAGCCTTGGAG 2 8 3' arm Bos_taurus mirbase 100 eca-mir-301b 2e-33 -43 (((.(((((((.(.((((((.((((((.((((((((.....((((....))))))))))))....)))))).)))))).))).)))))...))). (-43.00)