mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCATCCCCTAGGGCATTGGTGT CCACTGCCCCAGGTGCTGCTGG AACTGGCTATGCCTCCCCGCATCCCCTAGGGCATTGGTGTAAAGCTGGAGACCCACTGCCCCAGGTGCTGCTGGGGGTTGTAGTCTGAC 5 1 5' arm Bos_taurus mirbase mir-324 2e-33 mmu-mir-324 1e-40 -39.2 ....((((((..(((((.(((.(.(((.(((((.(((.((..........))))).))))).))).).))).)))))..)))))).... (-39.20)