mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAGAGCAATAACGAAAAATGT GTTTTTCATTATTGCTCCTGACC TTTTGGGCGGGGGTCAAGAGCAATAACGAAAAATGTTTGTCATAAACCGTTTTTCATTATTGCTCCTGACCTCCTCTCATTTGCTGTACTCA 3 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-335 5e-37 hsa-mir-335 1e-40 -39.5 ...((((.((((((((.(((((((((.((((((((.((......)).)))))))).))))))))).)))))))).))))............. (-39.50)