mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCGTCTCAGTTACTTTATAGCC TTATAAAGCAATGAGACTGATT TTGTACCTGGTGTGATTATAAAGCAATGAGACTGATTGTCATGTGTCGTTTGTGGGATCCGTCTCAGTTACTTTATAGCCATACCTGGTATCTTA 6 1 3' arm Bos_taurus mirbase mir-340 2e-45 hsa-mir-340 1e-46 -34.7 ..(((((.((((((..(((((((...((((((.((((.(((((.......))))))))).))))))....)))))))..)))))).))))).... (-34.70)