mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGACTCCTAGTCCAGTGCT CCCTGAACTAGGGGTCTGGAG ACCCAAACCCAGGTCTGCTGACTCCTAGTCCAGTGCTTGTGATGGCTGGTGGGCCCTGAACTAGGGGTCTGGAGGCCTGGGTTTGAATATC 4 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-345 7e-36 bta-mir-345 1e-46 -53.2 ...(((((((((((((.(.((((((((((.(((.(((..(.(....).)..))).))).)))))))))).).)))))))))))))...... (-53.20)