mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGGACTTTTGGGGGCAGATGTG CTATCATAATGCCCCTAAAAATCCTTA ACCGCAGGGAAAATGAGGGACTTTTGGGGGCAGATGTGTTTGCATTCCACTATCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCA 1 6 5' arm Bos_taurus mirbase mir-365 3e-38 bta-mir-365 3e-44 -35.4 ...((((((..((((((((..(((((((((((((((((.........))).)))....))))))))))).))))))))..)))))). (-35.40)