mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGTTCGCAGTTTCACC CCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAGCTTTCTTTATCCTTTGTTGTGTTTCATGACGATGGTTAAGAGATCAGTCTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCCGTTGACT GGAACAGAAAAATCTCTCTTTCTCTTTCTTGATCTGCTACGGTGAAGTCTATGGTGCACCGGCATCTGATGAAGCTGCCAGCATGATCTAATTAGCTTTCTTTATCCTTTGTTGTGTTTCATGACGATGGTTAAGAGATCAGTCTCGATTAGATCATGTTCGCAGTTTCACCCGTTGACTGTCGCACCCTTCTATAAACCCTAAATTTTCTCTCTATCTTTTTTAGTTTGATTTTCAAGACACTTTGTTTCTCAATCTTCAGTCTGATTTTGTGAGCTTACTTCTCTTTCTGAGGCTATATATATTTCTTTTTCATAAGAATTTTCACTATATTGTTGTGTGTATGTGGATCTGAAGAATTTATGTTTTGTTAGGGTTATAGAGTTGCATGACTTTAGGAAACCCTAATTTGGTCTTTGACAAATTGAGTATATTTTTTTGGGTTATAAATGTGAAAATCTTCTTATGATGAAGCTAGGAAAGAGGAGCTTTGTTTTTTTTACAAAGATTATGGAATTTAGCAAATTGAGTTAATTATCTATAATTACGTTTTTGGGGATCTCAAGATAGACTTCCTAGTTCCTCTTTTTACCCCTATCTGA 1 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirnest MIR167_1 9e-64 ath-MIR167a 5e-65 -40.8 .(((...))).(((((((((.((((((((((((((.(((.(((((..((.((((((((...)))))))).))...)))))..)))...)))))))))))))).))))))))).......... (-40.8)