mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATAATACATGGTTGATCTTT AGATCGACCGTGTTATATTCG TGAAGGGAGATCGACCGTGTTATATTCGCTTTATTGACTTCGAATAATACATGGTTGATCTTTTCTCAG 2 0 3' arm Bos_taurus mirbase mir-154 3e-25 mml-mir-369 1e-33 -29.1 (((..(((((((((((((((..((((((............))))))..)))))))))))))))..))). (-29.10)