mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCATAGAGGAAAATCCACAT GTAGATTTTCCTTCTATGATTA GGTATTTAAAAGGTAGATTTTCCTTCTATGATTACGGGTTTGGTGATTAATCATAGAGGAAAATCCACATTTTCGGTATCAA 2 1 3' arm Bos_taurus mirbase mir-154 3e-22 oar-mir-376d 1e-36 -27.9 (((((..((((.((.(((((((((.(((((((((...(((....))))))))))))))))))))).)).))))..))))).. (-27.90)