mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTAGACTATGGAACGTAGG TATGTAACATGGTCCACTAAC TGGTTCCTGCAGAGATGGTAGACTATGGAACGTAGGCTTTGTGATTTTTGACCTATGTAACATGGTCCACTAACTCTCAGTATCCA 3 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-154 7e-36 oar-mir-379 6e-36 -33.6 .((...(((.((((.((((.(((((((..((((((((............).)))))))..))))))).)))).)))))))...)). (-33.60)