mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGGTTCACCGAGCAACATTC AAAGTTGCTCGGGTAACCTCTC TGATACCGAAAAGGGGTTCACCGAGCAACATTCGTCGTCCAGATGCAAAGTTGCTCGGGTAACCTCTCCCCGCGTACCA 3 1 5' arm Bos_taurus mirbase mir-154 2e-32 bta-mir-409a 1e-39 -33.6 .(.(((((...(((((((..(((((((((.((((((.....)))).)).)))))))))..)))))))...)).))).). (-33.60)