mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATATAACACAGATGGCCTGT AGGTTGTCTGTGATGAGTTCG GGGTACTTGAGGAGAGGTTGTCTGTGATGAGTTCGCTTTATTAATGACGAATATAACACAGATGGCCTGTTTTCAGTACCA 5 0 3' arm Bos_taurus mirbase mir-154 1e-30 oar-mir-410 9e-41 -38.1 .((((((.(((((.((((..((((((.((.((((((.........).))))).)).))))))..)))).))))))))))). (-38.10)