mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTTCACCTGGTCCACTAGCTGT GGATGGTCGACCAGTTGGAAAGTAA CTGGGGTACAGGACGGATGGTCGACCAGTTGGAAAGTAATTGTTTCTAATGTACTTCACCTGGTCCACTAGCTGTCCGTACCCACTGCAG 3 2 3' arm Bos_taurus mirbase mir-412 7e-30 oar-mir-412 1e-43 -38.3 ...((((((.((((((.((((.((((((.(((..((((((((....)))).))))))).)))))).)))).))))))))))))....... (-38.30)