mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCAACAGACATTAATTGGGCGC CTCATTAAATGTTTGTTGAATGA GCACATTGTAGGCCTCATTAAATGTTTGTTGAATGAAAAAATGAATCATCAACAGACATTAATTGGGCGCCTGCTCTGTGATCTC 3 2 3' arm Bos_taurus mirbase 100 hsa-mir-421 4e-43 -35.2 .((((..((((((((((...((((((((((((.(((.........)))))))))))))))...)))).))))))..))))..... (-35.20)