mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCAGCAATTCATGTTTTGA AAAACGTGAGGCGCTGCTATA TCGTTGACTCCGAGGGGATGCAGCAGCAATTCATGTTTTGAAGTGCTTTAAACGGTTCAAAACGTGAGGCGCTGCTATACCCCCTTGCGAGGAAGT 3 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-322 3e-26 eca-mir-424 2e-36 -45.9 .......((((((((((.((.((((((..(((((((((((((.((.......)).)))))))))))))..)))))).)).))))))).)))..... (-45.90)