mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCATGATGGGCTCCTCGGTGT TACGGTGAGCCTGTCATTGTTCAGAGAGGCTAGATCC TGGCCGGGGAGAAGTACGGTGAGCCTGTCATTGTTCAGAGAGGCTAGATCCTCCTTGTTGAGAAGGATCATGATGGGCTCCTCGGTGTTCTCCAGGTAGCGGCACCACACCATGAAGGCAGCCC 5 15 3' arm Bos_taurus mirbase mir-433 3e-39 mmu-mir-433 3e-57 -45.6 ..(((..((((((...(((.((((((((((..(((......)))..((((((.(((...))).)))))).)))))))))).)))...)))))).(((.(.(....).)))).....)))..... (-45.60)