mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTGCCTTTGGACTACATC TGCAGTCCATGGGCATATACA TCCCTGGCGTGAGGGTATGTGCCTTTGGACTACATCGTGGAAGCCAGCACCATGCAGTCCATGGGCATATACACTTGCCTCAAGGCCTA 3 0 5' arm Bos_taurus mirbase mir-455 1e-37 mml-mir-455 2e-45 -41.6 .....(((.(((((((((((((((.((((((.(((.(((........))).))).)))))).)))))))))).....)))))..))).. (-41.60)