mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTGTACTGAGCTGCCCCGAG AGCTCGGGTCAGCTCAGTACCGGGCG GCCAGCTTGGACCTGCGTCCTCCCTGACGGGTCCTGTACTGAGCTGCCCCGAGGCCCTTCGCTGTGCCCAGCTCGGGTCAGCTCAGTACCGGGCGCGTCGGGGTGGGAGTCGGCCGGAAGCAGG 2 4 5' arm Bos_taurus mirbase mir-486 4e-29 ssc-mir-486-2 8e-30 -75.4 .((.((((((.((.((..((.((((((((.((((.(((((((((((.((((((((.(......).)))....))))).))))))))))).)))).)))))))).))..)).))))..)))).)) (-75.40)