mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAAAGGCTGTTTCTTGGTC CCCAGATAATGGCACTCTCAAAC GAGAATCATCTCTCCCAGATAATGGCACTCTCAAACAGGTTTCCAGGTTGTTTGAAAGGCTGTTTCTTGGTCAGAAGACTCTCAATTCCTTCTGGA 4 2 3' arm Bos_taurus mirbase mir-488 2e-33 mmu-mir-488 1e-37 -31.2 ((((.((.(((..((.(((.((((((.((.((((((((.(.....).)))))))).))))))))))).))..))).)).))))...(((....))) (-31.20)