mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGACATCACATATATGGCGAC GGTCGTATGTGTGGCGCCATCT GTGGCAGCTTGGTGGTCGTATGTGTGGCGCCATCTACTGGAACGTTTAGGAGTGACATCACATATATGGCGACTAAACTGCT 4 0 3' arm Bos_taurus mirbase mir-489 1e-30 cfa-mir-489 5e-27 -34 ..(((((.(((((.((((((((((((..(.(((...(((((...)))))..))).)..)))))))))))).))))).))))) (-34.00)