mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACCTGGAGGACTCCATGCTG CCATGGATCTCCAGGTGGGT TGGAGACTTGCTGGTTTGGAAAGTTCATTGTTCGACACCATGGATCTCCAGGTGGGTCACGTTTAGAGATACACCAACCTGGAGGACTCCATGCTGTTGAGCTGTTCACAAGCAGCGGACACTTCTA 2 2 3' arm Bos_taurus mirbase mir-490 8e-52 mml-mir-490 2e-58 -49.3 .((((..((((((.(((((((........((((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).))))))))..))).))))))))))...)))).. (-49.30)