mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGGGGAACCCTTCCATGAGG TTATGCAAGATTCCCTTCTAC TTGACTTAGCTGGGTAGTGGGGAACCCTTCCATGAGGAGTAGAACACTCCTTATGCAAGATTCCCTTCTACCTGACTGGGTTGG 3 1 5' arm Bos_taurus mirbase mir-491 2e-29 eca-mir-491 2e-42 -43.6 (..((((((..((((((.((((((..(((.((((((((((.....)))))))))).))).)))))).))))))..))))))..) (-43.60)