mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGGTCTACTGTGTGCCAGG TTGTACATGGTAGGCTTTCATT CTGGCCCCCAGGGCCTTGTACATGGTAGGCTTTCATTCATTCGTTTGCACATTCGGTGAAGGTCTACTGTGTGCCAGGCCCTGTGCCAG 1 0 3' arm Bos_taurus mirbase tRNA 0.00002 oar-mir-493 2e-45 -50.4 (((((...((((((((.((((((((((((((((((((.....((....))....)))))))))))))))))))).)))))))).))))) (-50.40)