mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCAGCACACTGTGGTTTGTA CAAACCACACTGTGGTGTTAGAGCGAG CCACCCCAGTCCTGCTCCCGCCCCAGCAGCACACTGTGGTTTGTACGGCACTGTGGCCACGTCCAAACCACACTGTGGTGTTAGAGCGAGGGTGGGGGAGGCACCGCTGAGG 3 5 5' arm Bos_taurus mirbase mir-497 2e-49 mml-mir-497 3e-54 -53.5 ...((.(((((((.((((((((((((((.((((.(((((((((.(((((......)))..)).))))))))).)))).)))).....).))))))))))))....)))).)) (-53.50)