mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGAAGCCCTGGAGGGGCTGGAG CCGGTTCTCAGGGCTCCACC GCCGCCGACCTGGCAGGCCAGGAAGAGGAGGAAGCCCTGGAGGGGCTGGAGGTGATGGATGTTTTCCTCCGGTTCTCAGGGCTCCACCTTTTCCGGGCCGTGGAGCCAGGGCTGGTGC 1 3 5' arm Bos_taurus mirbase mir-671 1e-35 mml-mir-671 4e-50 -74.2 ..(((((.((((((.((((.((((((((.(((.((((((..(((((((((((.(((....)))..)))))))))))))))))))).)))))))).)))).....))))))..))))). (-74.20)