mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCCTGATGATGCTGC ATTGTCATTGGGAGGTTGTG TGCATTGTCATTGGGAGGTTGTGGCGGAAATGTGAGAATCCTGATGATGCTGC ACAAATTTGTACCTTCAAAATTTTAAGGAGTCCTCTTTACCAAAAAAAAATTATTTTCAAATTAAACAAACCTTATTAGGTTAAGAAATTTTGGAGAAGAATTAAAATTTAACAACAAAATTACACATTTTTTTTAACCATTAATTGGATAAGGTTTTTTTTAACAAACAAATTTTGGATGTAAAAAAAAAAACTTTTCTCATTGATTTGGGAAAATTGGATCTTGGTTTGTGAAAAATCTAAAACCAAAATGACATTTTTGGAAGGGGGACTAGAGTGTGGAGAGAGAGAGAGATGGTAAAAAAACCCTCATATGTCCCCTTACAAGTTAAGGGTGTGGATAAAAGTAACCACGTGTTGCATTGTCATTGGGAGGTTGTGGCGGAAATGTGAGAATCCTGATGATGCTGCT 5 1 3' arm Arabidopsis_thaliana mirnest mir-172 0.0001 sbi-MIR172f 0.000009 -18.6 .(((.(((((((((((..((...(((....)))..)).))))))))))).))) (-18.6)